Kayseri yamula bölgesinden çıkarılan 7.5 milyon yıllık fil başta olmak üzere çıkarılan fosillerin sergileneceği  yeni müze binasının mekansal olarak geniş açıklıklara sahip olması kadar mevcut müze binasının özgünlüğünü bozmadan tasarlanması en önemli kriter olmuştur. Ayrıca parselin güneyinde yer alan Tarihi Millet Hastanesi silüeti göz önünde bulundurularak hastane saçak kotu seviyesinin altında projelendirme yapılmıştır. Parsel içerisindeki ilave yapı hiçbir şekilde, sonradan bu parsele taşınan Tümülüs ve mezar odasını etkilememektedir.   Mevcut müzeye eklemlenen yapı hem mevcut ile bir arada hem de onun cephe karakterini ortaya çıkaran bir tasarıma sahip olması önemsenmiştir. Bu nedenle yeni binanın özellikle mevcut yapıya dokunduğu noktalarda çelik ve cam malzeme kullanılmıştır. Mevcut yapının cephe malzemeleri aynen korunmuş olup özellikle doğu cephesinin özgün karakteri ek yapı içerisinden algılanması sağlanmıştır.